Σύμφωνα με το άρθρο 4 του ν. 2773/1999, όπως τροποποιήθηκε με το άρθρο 27 του ν. 3377/2005 (ΦΕΚ Α΄ 202/19.8.2005), η ΡΑΕ είναι συλλογικό όργανο το οποίο συγκροτείται πλέον από επτά (7) μέλη. Κριτήρια για την επιλογή των μελών της ΡΑΕ είναι (α) η διάκρισή τους για την επιστημονική κατάρτιση και την επαγγελματική ικανότητα, και (β) η εξειδικευμένη πείρα σε θέματα αρμοδιότητας της Αρχής. Τα μέλη επιλέγονται ύστερα από προκήρυξη που δημοσιεύεται σε τέσσερις τουλάχιστον ημερήσιες εφημερίδες πανελλήνιας κυκλοφορίας και διορίζονται με απόφαση του Υπουργού Ανάπτυξης. Ύστερα από πρόταση του Υπουργού Ανάπτυξης και γνώμη της Επιτροπής Θεσμών και Διαφάνειας της Βουλής, τρία (3) από τα ανωτέρω μέλη της ΡΑΕ επιλέγονται από το Υπουργικό Συμβούλιο και διορίζονται με πράξη του στις θέσεις του Προέδρου και των Α' και Β' Αντιπροέδρων της Αρχής αυτής.